메타게놈 시퀀싱 시장 규모, 점유율, 동향 분석 보고서 - 용도별(창약, 임상 진단, 토양 마이크로바이옴, 산업 응용, 생태 환경, 수의사), 제품 및 서비스별(시약 및 소모품, 기기, 시퀀싱 서비스, 분석 및 데이터 분석 솔루션), 기술별(16s RNA 시퀀싱, 샷건 메타게놈 시퀀싱, 전체 유전체 시퀀싱 및 데노보 어셈블리, 메타전사체학), 워크플로우별(샘플 준비, 시퀀싱, 데이터 처리 및 분석), 예측 기간(2025-2035년)
산업 개요
세계의 메타게놈 시퀀싱 시장은 2024년에 22억 달러로 평가되었고, 예측 기간(2025-2035년)에 CAGR 17.7%로 성장해, 2035년에는 137억 달러에 달할 것으로 예측됩니다. 메타게놈 시퀀싱 분야는 차세대 시퀀싱 기술의 발전으로 정확성, 처리 속도, 비용 효율성이 크게 향상되었으며, 전체 용도에 대한 광범위하고 신속한 도입이 촉진되는 것이 주요 요인이 되어 지속적인 성장을 이루고 있습니다. 질병의 조기 발견과 맞춤형 의료가 점점 중시되고 있는 것도 기술 수용의 가속을 뒷받침하고 있습니다. 헬스케어와 환경연구의 두 분야에서 마이크로바이옴 연구에 대한 투자가 활발해지고 있으며, 이는 시장의 성장, 정부의 경기자극책, 유전체학의 혁신을 촉진하는 관민 파트너십을 자극하고 있습니다. 감염증 증가와 항생제 내성은 보다 종합적인 미생물 프로파일의 필요성을 높여줍니다. 게다가 세계적으로 확대되는 생명공학과 제약산업은 생물학적 영향의 추진력으로 작용하고 있습니다.
시장 역학
유전체 시퀀싱 비용 저하
World Intellectual Property Organization(WIPO)의 2025년 3월 발표에 따르면 총 유전체 시퀀싱 비용이 2001년 약 1억 달러에서 2023년까지 미국에서 5억 달러 강까지 상당히 감소된 것은 건강 관리의 혁신을 추진하는 데 있어 매우 중요한 요인이었으며, 정확한 진단을 파악하고 목표 치료 전략을 개발하는 능력을 크게 향상시켰습니다. 이러한 극적인 비용 절감은 고해상도 유전체 분석에 대한 비용 절감 및 접근성을 통해 메타게놈 시퀀싱을 포함한 많은 새로운 유전체 기술의 채택을 가속화할 것으로 보입니다. 특히 중저소득 국가에서는 이 기술에 대한 공정한 접근을 제공하는 것이 필수적이지만 여전히 과제입니다. 광학적 유전체 매핑(OGM)을 세계적으로 확대하고 정밀의료를 지원하며 국제적 규모로 유전체 연구를 추진할 가능성을 극대화하기 위해서는 저렴한 가격과 이용성을 확보하는 것이 필수적입니다.
롱 리드 시퀀싱의 진보
롱 리드 시퀀싱 기술의 향상은 메타게놈 시퀀싱 업계에 이익을 가져왔습니다. 롱 리드 시퀀싱 기술은 복잡한 미생물 유전체을 정확하게 조립하고 유전체 서열의 구조적 돌연변이를 더 잘 확인할 수 있는 추가 도구를 제공함으로써 메타게놈 시퀀싱 노력을 추진하고 있습니다. 롱 리드 시퀀싱은 긴 유전자를 전체 길이로 회수할 수 있으며(환경, 임상, 또는 산업적) 많은 다양한 마이크로바이옴에서 발견되는 매우 반복성이 있거나 현저한 존재가 적은 서열을 해결할 수 있습니다. 또한, 더 긴 리드는 분류학적 해상도 향상에 기여하고 메타게놈 군집의 구조에 대한 추가 통찰력을 제공합니다.
시장 세분화
시장을 선도하는 샷건 메타게놈 시퀀싱 부문
메타게놈 시퀀싱 시장 성장 촉진요인 중 하나는 샷건 메타게놈 시퀀싱의 채택이 증가하고 있다는 것입니다. 샷건 메타게놈 시퀀싱은 모든 샘플 유전 물질을 시퀀싱하므로 미생물 집단 전체에 대한 정보를 얻을 수 있습니다. 낮은 존재량의 생물, 신규 병원체, 항생제 내성 유전자의 검출에 사용할 수 있기 때문에 임상, 환경, 연구의 장면에서 위력을 발휘합니다. 연구원은 식품 유래 병원체 및 박테리아 병원체를 확인하는 데 사용되는 타겟 시퀀싱 방법과 동등하거나 그 이상의 해상도를 제공할 수 있는 샷건 메타게놈 시퀀싱을 지지합니다. 게다가, 시퀀싱 비용은 세계적으로 낮아졌고, 새로운 강력한 생물 정보학 도구는 새로운 용도, 진단(인간 및 환경), 마이크로바이옴 연구 및 역학에 보다 광범위하고 신속한 도입을 가능하게 했습니다. 예를 들어 Illumina Inc.의 시퀀서 시리즈는 고처리량 샷건 메타게놈 시퀀싱 플랫폼으로 업계를 선도하고 있습니다. 메타게놈 시퀀싱 분야의 성장에 공통적인 것은 신뢰할 수 있는 정확성과 밀도가 높은 데이터 소스의 필요성입니다.
임상 진단: 시장 성장의 주요 부문
임상 진단 벤치마크 분야가 메타게놈 시퀀싱 시장의 잠재적인 지배적 원동력으로 발전하는 가운데 진단 플랫폼으로서의 메타게놈 시퀀싱에는 병원체의 존재를 사전에 알지 않고 폭넓은 병원체를 검출하고, 병원체를 동정하고 심지어 병원체의 의심을 나타내는 힘이 있습니다. 여기의 목표는 메타게놈 시퀀싱을 사용하여 잠재적인 치료법을 임상의에 알리고 감염의 효과적인 치료를 다루는 것으로 환자의 결과를 향상시키는 것입니다. 진단용 메타게놈 시퀀싱은 항균제 내성에 대한 임상 통찰력을 제공하고 임상의의 의사 결정에 정보를 제공할 수 있습니다. 또한 신규 병원체나 희소 병원체, 면역 결핍 환자에서 복수의 병원체에 대한 마지막 수단으로서 효과적인 진단 방법입니다. 예를 들어, Oxford Nanopore Technologies의 MinION 시퀀싱 플랫폼에서 사용되는 장치는 이미 실시간 임상 진단에 통합되어 있습니다. 감염의 속도가 빨라지는 가운데, 진단용 메타게놈 시퀀싱의 채용은 매우 빠르게 진행되고 있으며, 그 잠재적인 가능성은 여전히 성장하는 것으로 알려져 있습니다.
세계의 메타게놈 시퀀싱 시장은 또한 지역별로 북미(미국과 캐나다), 유럽(영국, 독일, 프랑스, 이탈리아, 스페인, 러시아, 기타 유럽), 아시아태평양(인도, 중국, 일본, 한국, 호주, 뉴질랜드, ASEAN 국가, 기타 아시아태평양), 세계 기타 지역(중동 및 아프리카, 중미).
유럽에서의 의료 연구 및 헬스케어 분야에서의 용도 확대
영국 제약공업협회(ABPI)에 따르면 2024년 8월 의학연구 및 헬스케어에 있어서 중요한 응용에 견인되어 세계 유전체 시장이 대폭 성장하는 것을 강조했습니다. 시장은 2021년과 2025년 사이에 107억 5,000만 파운드(116억 달러) 확대될 것으로 예측됩니다. 영국에서는 최근 유전체학 활동에 의해 추정 24억 파운드(25억 달러)의 총 매출이 탄생하고 있습니다. 영국은 Bioindustry Association(BIA), Medicines Discovery Catapult(MDC), Wellcome Sanger Institute의 지원에 의해 유전체 능력의 세계적 리더로 두각을 드러내고, 영국의 유전체 관련 기업 140개사 이상을 특정해 그 추정 매출은 24억 달러에 달했습니다. COVID-19 유전체학 UK 컨소시엄(COG-UK)과 국가 차원의 대규모 진단 및 시퀀싱을 포함한 강력한 유전체 생태계는 COVID-19 팬데믹학에 대한 영국의 대응에 중요했습니다. 이 강력한 기반, 특히 메타게놈 분석은 유전체 기술이 계속 발전하고 유전체 분석이 연구 및 임상 진단 분야에서 더 널리 채택됨에 따라 빠르게 성장하는 태세를 유지하고 있습니다. 이 성장은 국제 규모의 혁신과 정밀의료에 대한 길을 열 것입니다.
북미가 주요 점유율로 시장을 독점
메타게놈 시퀀싱의 북미 시장은 다양한 요인의 결과로 견조한 확대를 이루고 있습니다. 이 지역에는 확립된 첨단 연구 기관이 많이 있습니다. 이 지역에는 많은 생명 공학 기업이 설립되었습니다. 유전체학와 정밀의료에 대한 관민의 투자는 계속 확대되고 있으며 시장 성장을 뒷받침하고 있습니다. 만성 질환과 감염의 만연은 신규하고 고급 진단 검사 개발의 필요성을 부추기고 있습니다. 정부의 메타게놈 기술을 지원하는 정책과 자금 제공 이니셔티브는 시퀀싱 기술 이외의 개발을 촉진합니다. 이 지역의 헬스케어 시스템은 잘 발달하고 있어 프로그램이나 정책 입안자가 지원하는 최신 기술의 조기 도입이 가능합니다. 학술계와 산업계를 중심으로 한 과학 커뮤니티는 공동 연구를 촉진하고 과학의 진보를 보다 신속하게 실현하는 데 도움이 됩니다. 임상과 환경에의 적용을 위한 미생물 유전체학의 인지도 향상은 시장의 지속적인 성장을 뒷받침할 것으로 보입니다.
최근 동향
Metagenomic Sequencing Market Size, Share & Trends Analysis Report by Application(Drug Discovery, Clinical Diagnostic, Soil Microbiome, Industrial Applications, Ecological and Environmental and Veterinary), by Product & Service (Reagents and Consumables, Instruments, Sequencing Services, and Analysis and Data Interpretation Solutions), by Technology (16s RNA Sequencing, Shotgun Metagenomic Sequencing, Whole-Genome Sequencing and De Novo Assembly, and Metatranscrigptomics), and by Workflow (Sample Preparation, Sequencing, and Data Processing and Analysis), Forecast Period (2025-2035)
Industry Overview
Metagenomic sequencing market was valued at $2.2 billion in 2024 and is projected to reach $13.7 billion by 2035, growing at a CAGR of 17.7% during the forecast period (2025-2035). The metagenomic sequencing sector is experiencing sustained growth, largely propelled by advancements in next-generation sequencing technologies that have significantly enhanced accuracy, processing speed, and cost-efficiency, facilitating broader and more rapid adoption across applications. The increasing emphasis on early disease detection and personalized medicine supports the accelerating acceptance of technology. There are more investments in microbiome research, both within healthcare and environmental research, that are stimulating market growth, government stimulus funding, and public/private partnerships promoting innovation in genomics. The rise of infectious disease outbreaks and antibiotic resistance is driving the need for a more comprehensive microbial profile. Furthermore, the expanding biotechnology and pharmaceutical industries across the globe are acting as a driver of biological impact.
Market Dynamics
Falling Cost of Genome Sequencing
According to the World Intellectual Property Organization (WIPO), in March 2025, the substantial reduction in the cost of whole genome sequencing from approximately $100 million in 2001 to just over $500 million in the US by 2023 has been a pivotal factor in advancing healthcare innovation, significantly enhancing the capacity to identify accurate diagnoses and develop targeted treatment strategies. This dramatic cost reduction is likely to accelerate the adoption of a number of new genomic technologies, including Metagenomic Sequencing, by reducing the cost and facilitating access to high-resolution genomic analysis. While it is essential to provide equitable access to this technology, particularly in low- and middle-income countries, it remains an issue. Ensuring affordability and accessibility is essential for the global expansion of Optical Genome Mapping (OGM), enabling its full potential to support precision medicine and advance genomic research on an international scale.
Advancements in Long-Read Sequencing
Improvements in long-read sequencing technologies are benefiting the metagenomic sequencing industry. Long-read sequencing technologies are advancing metagenomic sequencing efforts by providing additional tools to accurately assemble complex microbial genomes and better identify structural variants in genome sequences. Long-read sequencing methods can recover long genes as full length and resolve very repetitive or very low-abundance sequences, found in many diverse microbiomes (in environmental, clinical, or industrial contexts). Furthermore, longer read lengths can contribute to an improved taxonomic resolution, providing further insights into the structure of metagenomic communities.
Market Segmentation
Shotgun Metagenomic Sequencing Segment to Lead the Market
One of the primary drivers of growth in the metagenomic sequencing market is the rising adoption of shotgun metagenomic sequencing. Shotgun metagenomic sequencing provides information about entire populations of microbes, as it sequences every piece of genetic material from a sample. It can be used to detect low-abundance organisms, emerging (novel) pathogens, and antibiotic resistance genes, making it an asset in clinical, environmental, and research contexts. Researchers favour shotgun metagenomic sequencing for its capacity to provide resolution equal to and superior to targeted sequencing methods used for identifying foodborne and bacterial pathogens. Additionally, sequencing costs have decreased globally, and new, stronger bioinformatics tools have enabled broader and quicker uptake across new applications, diagnostics (human and environmental), microbiome research, and epidemiology. For instance, Illumina Inc. has a series of sequencers that are leading the way as a high-throughput shotgun metagenomic sequencing platform. The common denominator for growth in the metagenomic sequencing segment is the need for reliable accuracy and data sources that have density.
Clinical Diagnostic: A Key Segment in Market Growth
As the clinical/diagnostic benchmarking segment develops into a potential dominant driving force behind the metagenomic sequencing market, metagenomic sequencing as a diagnostic platform has the power to detect a wide range of pathogens with no prior knowledge of their presence, identify pathogens, and even indicate a suspected pathogen. The goal here is to enhance patient outcomes by using metagenomic sequencing to inform clinicians of potential treatments to work towards effectively treating infection. Diagnostic metagenomic sequencing can provide clinical insights into antimicrobial resistance, informing the decision-making for clinicians. Additionally, it is an effective diagnostic method of last resort for novel or rare pathogens and for multiple pathogens in patients who are immunocompromised. For instance, devices such as those used by Oxford Nanopore Technologies' MinION sequencing platform are already being embraced for real-time clinical diagnostics. The quickening pace of infectious diseases, the adoption of diagnostic metagenomic sequencing is indeed happening quickly, with known still-growing potential.
The global metagenomic sequencing market is further divided by geography, including North America (the US and Canada), Europe (the UK, Germany, France, Italy, Spain, Russia, and the Rest of Europe), Asia-Pacific (India, China, Japan, South Korea, Australia and New Zealand, ASEAN Countries, and the Rest of Asia-Pacific), and the Rest of the World (the Middle East & Africa, and Latin America).
Growing Applications in Medical Research and Healthcare in Europe
According to the Association of the British Pharmaceutical Industry (ABPI), in August 2024, highlighted the substantial growth of the global genomics market, driven by its critical applications in medical research and healthcare. The market is projected to expand by £10.75 billion ($11.6 billion) between 2021 and 2025. In the UK, genomics activities have created an estimated total turnover of £2.4 billion ($2.5 billion) in recent years. The UK has emerged as a global leader in genomic capabilities with the support of the Bioindustry Association (BIA), Medicines Discovery Catapult (MDC), and the Wellcome Sanger Institute, which identified over 140 genomics companies in the UK, with an estimated turnover of £2.4 billion ($2.5 billion). The strong genomic ecosystem was important to the UK's response to the COVID-19 pandemic, including the COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK) and large-scale diagnostics and sequencing on a national level. This strong base, particularly in metagenomic sequencing, is poised for rapid growth as genomic technologies continue to advance and as genomics becomes more widely adopted in both research and clinical diagnostics. This growth will pave the way for innovation and precision medicine on an international scale.
North America Region Dominates the Market with Major Share
The North American market for metagenomic sequencing is experiencing solid expansion as a result of many different factors. The region has a large number of established advanced research agencies. Many biotechnology companies have been established in the area. Public and private sector investments in genomics or precision medicine continue to grow, helping to propel market growth. The rise in prevalence of chronic diseases and infectious diseases is fueling the need to develop novel and advanced diagnostic testing. Policies supporting metagenomic technologies from governments and funding initiatives will facilitate development beyond sequencing technology. The healthcare system in the region is well developed, allowing for early adoption of the latest technology supported by programs and policymakers. The science community around academia and industry promotes collaborations and is helping to deliver scientific advancement more rapidly. Increased awareness of microbial genomics for clinical and environmental applications will assist in sustainable market growth.
The major companies operating in the global metagenomic sequencing market include BGI Genomics, Illumina, Inc., Oxford Nanopore Technologies, QIAGEN N.V., and Thermo Fisher Scientific Inc., among others. Market players are leveraging partnerships, collaborations, mergers, and acquisition strategies for business expansion and innovative product development to maintain their market positioning.
Recent Developments